aslında mac kullanıyorum ama, elimden geldiğince mkv ve mp4'le ilgili konularda yardımcı olmaya çalışayım..

windows için YAMB programını kullanarak, h264 ve x264 codecli mkv dosyalarını convert etmeden MP4 yapabilirsiniz..http://yamb.unite-video.com/
program çok basit, sadece istediğiniz dosyayı gösterip mp4, istediğiniz ses ve alt yazıları da ekleyerek mp4ünüzü oluşturabilirsiniz..
yalnız filminiz AC3 sesli ise PS3 ya da xbox'ınız sesi desteklemeyeceğinden, ayıca ac3 dosyasını imtoo video converter gibi bir program kullanarak filmden direkt olarak 2 ya da 5.1 AAC'ye çevirip YAMB içine ayrıca eklemenizi tavsiye ederim..

mac kullanıcıları ise MKVTools isimli programı kullanarak ister mkv filmlerini mp4 yapabilir, isterlerse altyazı vs ekleyebilirler..http://www.emmgunn.com/mokgvm2dvd/mokgvmhome.html

her iki program da mp4 dosyaları istediğiniz kadar bölebilmektedir.. fakat birleştirmenizi tavsiye etmem, pek işe yaramıyor..

yalnız her iki durumda da eklediğiniz altyazı konsolda görünüyor mu, emin değilim.. fakat VLC ile çalışması garanti :)

umarım yardımcı olabilmişimdir..